Events :: Cursos :: Análisis de datos genéticos en Ecología: Conceptos y Herramientas
Este curso tiene como principal objetivo dotar de herramientas bioinformáticas que permitan añadir una perspectiva genómica a los estudios en ecología. Al concluir el curso, los participantes conocerán el manejo de diferentes herramientas con las que abordar preguntas biológicas mediante aproximaciones basadas en transcriptómica, genómica comparativa y genómica de poblaciones.
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Objetivo:
Para conseguir el objetivo del curso, los participantes seguirán todo el proceso in silico de esta clase de estudios, desde explorar la calidad de las secuencias crudas hasta la visualización de los resultados finales. Además de la práctica, el curso contendrá contenido teórico que permitirá a los participantes entender conceptos clave y cómo adaptar cada análisis a su investigación y sistema de estudio Tras cursar los diferentes módulos, los asistentes tendrán una visión más amplia sobre las posibilidades de abordar cuestiones evolutivas en sus estudios mediante el análisis de datos genéticos.
Se usarán métodos computacionales basados en Linux y R. El curso contará con una introducción para trabajar en Linux dedicado a aquellas personas que no estén familiarizadas con sus comandos.
Programa:
| Módulo / Contenido | Profesor/es | Nº horas impartidas |
|---|---|---|
| 0. Introducción a Linux | Ana García Muñoz |
1 |
| 1. Genómica comparativa:Conceptos básicos. | Ana García Muñoz | 1 |
| 1.1-Práctica: Obtención y manipulación de datos, extracción de ortólogos y construcción de matrices. | Ana García Muñoz | 3 |
| 2. Genómica Poblacional: Conceptos básicos y Variabilidad. | Sebastián Ramos | 1 |
| 2.1 Práctica: Manipulación de datos NGS, filtrado y ensamblaje. | Sebastián Ramos | 1 |
| 2.2 Práctica con ANGSD | Sebastián Ramos | 2 |
| 3. Genómica Poblacional: Patrones Demográficos | Sebastián Ramos | 1 |
| 3.1 Práctica con ANGSD | Sebastián Ramos | 2 |
| 4. Genómica Poblacional: Patrones Selectivos | Sebastián Ramos | 1 |
| 4.1 Práctica con ANGSD | Sebastián Ramos | 2 |
| 5. Transcriptómica: Introducción teórica | Sebastián Ramos | 1 |
| 5.1 Práctica: Análisis de expresión diferencial | Sebastián Ramos | 4 |
Destinatarios:
El curso va especialmente dirigido a personas en fases tempranas o no de su carrera que tengan interés en aprender cómo incorporar y abordar el análisis de datos genéticos en sus investigaciones. Por tanto, está especialmente indicado para estudiantes predoctorales e investigadores postdoctorales que estén en vías de aprender nuevas técnicas y desarrollar sus propias ideas. Para un mejor aprovechamiento del curso, sería ideal que los participantes tengan un conocimiento previo del ambiente de trabajo en R (instalar paquetes, importar datos). En el caso de Linux, el curso incluye una introducción de los comandos básicos y de la instalación de los programas que se utilizarán. Los participantes deben traer su propio ordenador con R instalado. Para trabajar en el servidor se dará un usuario a cada participante y se recomienda tener instalado Putty (para los usuarios que no tengan Linux) y FileZilla o WinSCIP para facilitar la transferencia de archivos.
Características de la acción formativa:
Lugar: Facultad de Ciencias, Universidad de Granada
Fechas: 10-14 de noviembre de 2025
Horario: Lunes:15:00–20:00; martes,miércoles,jueves y viernes: 9:00–14:00
Horas lectivas: 20h
Duración: 5 días
Número de plazas: 20
Plazo de matriculación: hasta 20/10/2024
Precio: Socios Regulares y Estudiantes de la AEET/SIBECOL (incluidos miembros de la AIL, SEEEE y SPECO): 200 € (membresía sujeta a verificación); Resto de participantes: 300 €.
Criterio de admisión: preferible estudiante predoctoral y posdoctoral.
Profesorado:
Impartido por Sebastián E. Ramons Onsins (sebastian.ramos@cragenomica.es), Científico Titular CSIC, Centro de Investigación Agrigenómica (CRAG, Consorcio CSIC-IRTA-UAB-UB) y por Ana Garcia Muñoz (ana.garcia.munoz@urjc.es), Investigadora postdoctoral con Afiliación: (1) Departamento de Biología y Geología, Física y Química Inorgánica, Universidad Rey Juan Carlos (URJC), (2) Instituto de Investigación en Cambio Global (IICG-URJC), (3) Departamento de Genética, Universidad de Granada (UGR)
Certificación:
La organización aportará certificados de asistencia y aprovechamiento una vez finalizado el curso. La asistencia mínima requerida es del 90% de total de horas lectivas, sin posibilidad de eximente por falta justificada.
Inscripción :
Clickea en el enlace "Registrar" situado dentro del cuadro situado en la esquina superior derecha. La Secretaría de la AEET te enviará una notificación personalizada confirmándote la reserva de plaza e indicándote las instrucciones para proceder al pago de la cuota de inscripción.
Las cancelaciones de asistencia notificadas con menos de 30 días de antelación al comienzo del curso, no tendrán derecho a reembolso.
Pagos:
El pago ha de realizarse antes del 25 de octubre de 2025, mediante ingreso en cuenta o trasferencia bancaria a la CC: ES70 0073 01005804 9730 5102, en la entidad Openbank antes del comienzo del curso.
Una vez realizado el abono por favor enviadnos copia del comprobante de pago a secretaria@aeet.org. No olvides indicar los datos que deben constar en la factura.
Nuestros datos fiscales:
ASOCIACIÓN ESPAÑOLA DE ECOLOGÍA TERRESTRE
CIF: G50359017
Dpto. Biología y Geología
Universidad Rey Juan Carlos, URJC
c/Tulipán s/n
28933 Móstoles, Madrid
Cualquier información adicional en: e-mail: secretaria@aeet.org.
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