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Introducción a las Técnicas de Next Generation Sequencing: aplicaciones en ecología y evolución
 
Las técnicas de Next Generation Sequencing (en adelante NGS) están suponiendo una verdadera revolución en todos los ámbitos de la biología: biomedicina, biotecnología y por supuesto, en ecología y evolución. Este curso pretende mostrar una batería de potenciales aplicaciones de NGS que serán presentadas por investigadores que actualmente están trabajando con dichas técnicas. No se busca por tanto en una formación especializada y de manera profunda en una técnica específica y concreta (al ser un curso introductorio), sino en dar una visión amplia de varias posibles aproximaciones. El asistente al curso deberá finalizar el mismo familiarizado con las técnicas NGS y con una idea clara de que puede hacer con sus datos/preguntas/hipótesis y como profundizar en ellas.
 
Objetivos
 
  • El alumno tome conciencia de las distintas aplicaciones de las técnicas de NGS, su potencial y su complejidad.
  • Formar al alumno de manera básica en los principales softwares para cada una de las técnicas, en el manejo de datos y en cómo ampliar sus conocimientos. Esto incluye desde el análisis de la calidad de los archivos a su edición y análisis. Pretendemos que con esta base, el alumno podrá formarse posteriormente en caso que se vea interesado (por ejemplo, asistiendo a cursos de especialización o de manera autodidacta).
  • Favorecer el contacto entre alumnos y docentes en cada una de las técnicas de NGS para posibles colaboraciones o formaciones.
 
Destinatarios
 
Los destinatarios principales serán estudiantes de master o doctorado que emplearán las técnicas en sus investigaciones, pero también investigadores en posición senior o postdoctorales que quieran conocer las técnicas de investigadores que las están usando. No será necesaria ninguna formación previa específica, aunque se valorarán positivamente la formación en lenguajes de programación (“R”) y formación en genética de poblaciones.
 
Programa
 
Módulo / Contenido  Profesor  horas
Introducción a Técnicas NGS Alfredo García Fernández y Carlos Lara, Univ. Rey Juan Carlos  4
Introducción al uso de Linux y Pipelines sencillas Alfredo García Fernández y Carlos Lara, Univ. Rey Juan Carlos  4
Calidad y edición de datos NGS Alfredo García Fernández y Carlos Lara, Univ. Rey Juan Carlos  4
Genómica de Poblaciones, Genotyping by Sequencing y RAD-TAG
Irene Villa y Yurena Arjona, Real Jardín Botánico  4
Análisis de zonas con repeticiones en el genoma
Daniel Vitales, Institut Botanic de Barcelona  4
Ensamblaje de Novo
José Carlos del Valle e Inés Casimiro, Universidad Pablo de Olavide  4
Metagenómica
Andrea Messeguer y María Razzauti, CBGP-INRA, Francia  4
Transcriptómica
Santiago C. González-Martínez, Univ. De Burdeos-INRA, Francia
 4
Master Class: Genómica en árboles
Santiago C. González-Martínez, Univ. De Burdeos-INRA, Francia  2
Discusión de resultados y debate
Jose María Iriondo, Alfredo García Fernández y Carlos Lara, Universidad Rey Juan Carlos
 2 
 
 
Duración (en horas): 36 horas lectivas.
Número de plazas: 25
Fechas de realización: de 4 al 8 de julio. (programa de Universidad de verano de la URJC)
Lugar de celebración: Campus de Madrid (Vicalvaro) de la URJC, Madrid
Criterio de admisión: Matricularse en plazo.
Fecha comienzo del plazo de inscripción: 15 de Mayo de 2016
Fecha límite del plazo de inscripción: 1 de Junio de 2016
Precio: 150 euros.
 
 
Formulario solicitud ayuda
 
Becas de inscripción AEET
 
La AEET apoya la asistencia a este congreso con 3 becas de inscripción de 150 € cada una, destinadas a 3 de sus socios estudiantes. Se dará prioridad al orden de solicitud. Los interesados en solicitar la ayuda enviad a info@aeet.org el formulario de solicitud cumplimentado. Para recibir la ayuda será imprescindible adjuntar justificante de pago del evento y certificar la asistencia al mismo.